深圳单通道qPCR仪应用

时间:2023年06月04日 来源:

使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。定量 PCR (qPCR) 允许对靶 DNA 进行相对定量,并且是一种可靠的、已建立的测试特定序列是否存在的方法(例如,大多数基于 PCR 的冠状病毒测试使用 qPCR)。另一种 PCR 形式,数字PCR (dPCR) 或液滴数字 PCR (ddPCR),使用类似的化学方法检测 DNA 序列,但在许多微小体积或液滴中进行检测,利用数学的力量提高信噪比。qPCR和 dPCR 有很多相似之处和不同之处,但在与 PCR **交谈时,有几个重要的品质更加突出。尽管 dPCR 可能在灵敏度方面表现出色,但 qPCR 仍然是许多其他应用的比较好选择。“我们建议我们的客户在基因表达中使用 qPCR,因为它的动态范围很广;其量化不同表达水平、区分剪接变体和多重分析的能力;及其高通量应用和自动化的能力,”Alsarraj 说。事实上,它在实验室和监管环境中更为人所知,并用于基因、健康状况或传染病的筛查。使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。深圳单通道qPCR仪应用

实时荧光定量PCR(QPCR):一般用于检测样品中目的基因的表达量。比如:在实验过程中,构建了目的基因的过表达载体,转染进细胞后,实验中需要在转录水平和蛋白水平检测目的基因的表达,转录水平就需要用到QPCR,蛋白水平就是WB。也可用于检测基因组DNA中目的基因的拷贝数。主要步骤:从细胞/血液/组织中提取RNA,检测RNA纯度-去除基因组DNA-逆转录成cDNA-配置QPCR预混液-QPCR96孔板排版加样,3个复孔-上机QPCR仪器检测-据CT值分析实验结果。根据荧光类型主要分为荧光嵌合法(又称为染料法)和荧光探针法。 广州qPCR仪价格由于qPCR的高灵敏性,阴性对照有出现扩增信号的情况,那么在针对这类问题时,我们需要判断其原因所在。

利用SYBR Green I可以检测PCR反应中获得的全部双链DNA,但是不能区分不同的双链DNA。为了进一步确保荧光检测的就是靶DNA序列,人们又设计了能与目的DNA序列特异结合的荧光探针,如TaqMan探针。TaqMan探针是一小段被设计成可以与靶DNA序列中间部位结合的单链DNA(一般为50-150 bp),并且该单链DNA的5'和3'端带有短波长和长波长两个不同荧光基团。这两个荧光基团由于距离过近,在荧光共振能量转移(FRET)作用下发生荧光淬灭,因而检测不到荧光。PCR反应开始后,随着双链DNA变性产生单链DNA,TaqMan探针结合到与之配对的靶DNA序列上,并被具有外切酶活性的Taq DNA聚合酶逐个切除而降解,从而解除荧光淬灭的束缚,荧光基团在激发光下发岀荧光,所产生的荧光强度直接反映了被扩增的靶DNA总量。

qPCR的荧光标记方法分为以SYBR Green I染料法为主的荧光染料嵌合法,以Taqman探针法为主的荧光探针法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬灭染料引物法。SYBR Green I 是高灵敏度的非特异性双链DNA荧光染料,具有绿色激发波长。它以非特异性方式结合在dsDNA双螺旋小沟区域。游离的SYBR Green I 只发出极弱的荧光信号,PCR过程中,当扩增生成dsDNA时,SYBR Green I 逐渐与dsDNA结合,荧光信号被千倍放大,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。qPCR在原有PCR基础上与荧光检测方法结合,实现了PCR从定性到定量的飞跃,具有灵敏度高、特异性强的优点。

与标准 PCR 一样,SYBR Green 方案由变性、退火和延伸阶段组成。 不同之处在于,您在 qPCR 设置期间将一些双链 DNA 结合染料 SYBR Green I 添加到预混液中。 这种荧光染料在延伸阶段嵌入到双链 DNA 序列中,显示出荧光信号的强烈增加。 在每个热循环结束时测量此信号将使您能够确定存在的双链 DNA 的数量。SYBR Green 检测的缺点是染料会与任何双链 DNA 序列结合。 这意味着您还可以检测非特异性 qPCR 产物(例如引物二聚体)发出的荧光。 为消除这种风险,通过执行熔解曲线分析检查反应特异性,或使用 TaqMan 方法。q225pcr无需参比染料、无需定期校准,更加简化的操作流程与减轻的维护负担只为更好地专注于实验。深圳单通道qPCR仪应用

实时荧光定量PCR(QPCR):一般用于检测样品中目的基因的表达量。深圳单通道qPCR仪应用

TaqMan试剂:一开始,使用的是嵌入式染料进行的实时荧光PCR (qPCR) 产物定量。但是这些染料存在了重大缺点,即使会同时去检测特异性以及非特异性PCR产物的扩增量。TaqMan方法的开发通过去引入基于Taq DNA聚合酶5’核酸酶活性的荧光标记探针,实时定量PCR系统得到了的提升。这些荧光探针的使用,使得实时定量的方法得到了发展,实现了对特定扩增产物的检测。此外,荧光标记探针的开发,也免去了用于探针降解分析的PCR反应后处理的过程。深圳单通道qPCR仪应用

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