深圳单通道qPCR仪

时间:2023年06月11日 来源:

dPCR比qPCR准确度与精密度高。qPCR的效率会受到很多因素影响。例如:试剂保存不当导致部分样本降解、标准曲线偏斜导致CT值受到影响。dPCR 将样本分成若干小的 PCR 反应分区,可实现单分子检测,避免模板间的竞争效应的影响,可提高目的序列的检测准确度。由于dPCR较少受到扩增效率的影响,因此具有更高的准确度与精密度。qPCR面对小的差异较弱,dPCR则可识别差异较小的拷贝数。dPCR比qPCR重复性和通用性高。qPCR只能实现相对定量,即必须使用标准品生成标准曲线,才能进行定量。dPCR是定量,不需要利用标准品绘制标准曲线,也不依赖荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数,直接计算样品中目的核酸分子的个数,可实现定量,重复性和通用性高 。因此dPCR可用于常规qPCR所需的标准品定量,具有计量学意义 。在进行大量SNP标记分型时无需合成荧光探针和荧光引物。可以的节省实验成本。深圳单通道qPCR仪

1983年,美国化学家Kary Mullis发明了聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction, PCR),这一技术将DNA聚合酶的特性结合核酸双链的变性复性特性,采用适温延伸、高温变性以及低温复性,让目的核酸片段实现了特异性体外扩增,可将极微量的目标DNA特异地扩增上百万倍,从而提高对DNA分子的分析和检测灵敏度。尤其是耐热DNA聚合酶的发现,更是极大地促进了PCR技术在分子生物学科研,及临床分子诊断领域的广泛应用。常用的 PCR 技术包括逆转录PCR(Reverse Transcription PCR,RT-PCR)和实时荧光定量PCR(Real-time Quantitative PCR,qPCR)等。珠海快速qPCR仪型号qpcr在扩增每个循环中模板DNA通过变性、复性、延伸三个阶段形成更多的子代DNA,为下一个循环提供模板DNA。

而在指数增长期,由于底物充足,聚合酶活性高,反应产物以指数形式积累,且与初始模板量存在定量关系,因此,在该时期对模板起始量进行定量分析准确且重复性比较好。Ct值,是在指数增长期内,荧光信号到达荧光检测阈值时所经历的循环数,其中C循环(Cycle),t阈值(threshold)。每条扩增曲线的Ct值都与初始模板量的对数存在线性关系,初始模板的拷贝数浓度越高,对应的Ct值越小;反之则越大。因此,先根据已知拷贝数浓度标准品的扩增曲线拟合出标准曲线方程,再将样本扩增曲线的Ct值代入标准曲线方程中,便可计算未知样本初始模板的拷贝数浓度,从而实现定量分析。

了解了荧光阈值的概念后,Ct 值就很好理解了。C Cycle,t threshold,所谓 Ct 值就是在荧光 PCR 扩增过程中,当扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数。如上文中图所示,黑色的线显示的是荧光阈值,当信号超过黑色线时所经历的循环数即为 Ct 值。从这也可以了解到 Ct 值是可以变化的,我们实验时带有一定的人为因素。而荧光定量 PCR 后面的数据处理要用到 Ct 值来计算,所以有关荧光阈值的设置就显得尤为重要。一般说来,新手按荧光 PCR仪的自动设置为好,而如果你非常有经验,一般会手动设置荧光阈值。因为 Ct值即达到荧光阈值所经过的循环数,所以它就与模版的拷贝数存在着线性关系,起始拷贝数越多,经过的循环数就越少, Ct 值也就越小,反之亦然。正常的 CT值范围在 18-30 之间,过大和过小都将影响实验数据的精度。前面也提到过,同一模板经过 96 次 PCR 扩增,扩增产物虽然不恒定,但Ct 值极具重现性。根据这个特点,我们可以利用已知起始拷贝数的标准样品的。Ct 值做出标准曲线,只要在同一次 PCR 实验中得到未知样品的 Ct 值,就可以根据曲线算出该未知样品的起始拷贝数。定量检测是一种实时的PCR (qPCR) 检测。测量(定量)每轮PCR扩增循环中,检测目标核酸片段的量。

阴性对照一般是指用水代替模板的反应孔,体系中除了模板,包括了其他的反应组分。由于qPCR的高灵敏性,阴性对照有出现扩增信号的情况,那么在针对这类问题时,我们需要判断其原因所在。使用染料法进行qPCR实验时,首先查看阴性对照的溶解曲线主峰是否跟阳性孔的主峰位置一致。如果一致,要看两者Cq相差多少,比如,针对某一种引物的实验样品Cq值为28. 5,阴性对照的Cq值为33. 6,由于Cq值相差大于5,如果按95%的扩增效率计算,两者模板量相差28倍之多,对分析数据影响不大,所以实验样品的Cq值还是可以采用的;但是,如果两者的Cq值相差 1~2,这说明阴性对照中有较大的模板污染,则需要考虑更换试剂或引物,分区加样,重新实验。如果不一致,阴性对照主峰对应的Tm值小于阳性孔的Tm值,则可能是引物性能不好,无模板或使用低浓度模板下会出现引物二聚体,这种情况则需要考虑更换引物,保证引物特异性以及扩增效率。定量 PCR (qPCR) 允许对靶 DNA 进行相对定量,并且是一种可靠的、已建立的测试特定序列是否存在的方法。小巧qPCR仪作用

实时荧光定量PCR指在PCR反应体系加入荧光基团,荧光信号实时监测PCR,通过标准曲线对未知模板进行定量分析.深圳单通道qPCR仪

利用SYBR Green I可以检测PCR反应中获得的全部双链DNA,但是不能区分不同的双链DNA。为了进一步确保荧光检测的就是靶DNA序列,人们又设计了能与目的DNA序列特异结合的荧光探针,如TaqMan探针。TaqMan探针是一小段被设计成可以与靶DNA序列中间部位结合的单链DNA(一般为50-150 bp),并且该单链DNA的5'和3'端带有短波长和长波长两个不同荧光基团。这两个荧光基团由于距离过近,在荧光共振能量转移(FRET)作用下发生荧光淬灭,因而检测不到荧光。PCR反应开始后,随着双链DNA变性产生单链DNA,TaqMan探针结合到与之配对的靶DNA序列上,并被具有外切酶活性的Taq DNA聚合酶逐个切除而降解,从而解除荧光淬灭的束缚,荧光基团在激发光下发岀荧光,所产生的荧光强度直接反映了被扩增的靶DNA总量。深圳单通道qPCR仪

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