深圳微滴式数字PCR如何选型

时间:2020年08月07日 来源:

研究方向

基因表达差异研究

检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的***定量,从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况:microRNA、lncRNAs等的表达分析、等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、Exosome内核酸分子定量分析等。


拷贝数变异(CNV)研究

微滴化的样品处理及检测,这种摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的***拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了***的检测精度。是其他诸如二代测序、芯片杂交等平台无法达到的,因此采用数字PCR能够有效对NGS、aCGH的实验结果进行验证,并具有成本低、通量高的特点。


全封闭体系,自动化流程操作。深圳微滴式数字PCR如何选型

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与常规的PCR的方法相比,dPCR有很好的优势。

***定量

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行***定量。

样品需求量低

在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。

高灵敏度

ddPCR本质上是将一个传统的PCR反应分成了数万个**的PCR反应,在这些反应中可以精确地检测到很小的目的片段的差异、单拷贝甚至是低浓度混杂样品,且能避免非同源异质双链的形成。

高耐受性

由于目的序列被分配到多个微滴中,***降低了体系间的影响以及背景序列和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 常州广东数字PCR哪家好无创产前筛查:低成本、快速。

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MicroDrop-100数字PCR系统具有如下优点:

1、JUE对定量,结果判读不需要依赖标准曲线;

2、突破局限,检测灵敏度可低至万分之一;

3、专利设计的具有高精度复杂三维微纳防污染结构的微流控芯片,单张可同时处理1-8个样本;

4、一键式自动操作,20uL PCR体系可生成100,000微滴,8个样本单次微滴生成*需2分钟;

5、FAM、HEX(VIC)双荧光通道,半导体激光器做为激发光源相比LED光源,稳定性高,功率稳定不影响检测灵敏度,单色性能优异降低对检测特异性的影响,且方向性好;

6、检测器为2个光电倍增管,灵敏度及增益优于MPCC或CCD,普通的硅光子计数器,增益为10^5,光电倍增管增益可以达到10^9;

7、**知识产权的软件系统可直接计算拷贝数、拷贝数浓度,CNV 值,突变丰度;阈值线可自动或手动完成,每个样本可单独设定阈值线;输出数据图标、直方图、一维图、二维图、浓度图、95%置信度不确定性区间等;软件可自动识别复杂微滴分簇四簇;软件具备数据质控功能,支持阳性微滴数、阴性微滴数、总微滴数统计及这些指标的任意组合;单个样本100,000微滴的反应体系以及高灵敏度的检测系统,配以独特的软件系统,可以实现高达20重的PCR分析;

8、单次检测通量96个样本,操作灵活;

与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:

  1. 能够***定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行***定量。

  2. 样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本

  3. 灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个**PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。

  4. 高耐受性:由于目的序列被分配到多个**反应体系中,***降低了背景信号和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 关于病原菌的检测鉴定。

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我国***拥有完全自主知识产权的微滴式数字PCR仪MiniDrop™研发成功并投入生产。MiniDrop™创新性采用高压驱动的方法将样本分割成50万份,打破了国外厂商在微滴式数字PCR领域的垄断。永诺生物依以微滴式数字PCR仪为**,打造了全自动液体处理工作站、核酸提取试剂盒等创新产品,致力于解决**、***领域的精细诊断这是国内***微滴式数字PCR检测系统,能广泛应用于医疗、农业、环境等领域,未来,采用外周血、唾液、尿液、脑脊液等样本进行低成本、高灵敏、快速的无创检测成为可能。
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支持多重数字PCR,可选全中文分析软件。深圳微滴式数字PCR如何选型

dPCR的基本原理

目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。 深圳微滴式数字PCR如何选型

可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。

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